Gold Coast (Australie), Nous vivons avec le COVID depuis plus de quatre ans. Même s’il reste encore beaucoup à apprendre sur le SRAS-CoV-2 (le virus responsable du COVID), au moins une chose semble claire : il est là pour rester.

De la variante originale de Wuhan à Delta, en passant par Omicron et plusieurs autres entre les deux, le virus a continué d'évoluer.

De nouveaux variants ont provoqué des vagues répétées d’infection et ont mis au défi les médecins et les scientifiques qui cherchaient à comprendre le comportement changeant de ce virus.Nous sommes désormais confrontés à un nouveau groupe de variantes, les variantes dites « FLiRT », qui semblent contribuer à une vague croissante d’infections au COVID en Australie et ailleurs. Alors d’où viennent-ils et sont-ils préoccupants ?



Un descendant d'OmicronLes variantes FLiRT sont un groupe de sous-variantes de JN.1 de la lignée Omicron.

JN.1 a été détecté en août 2023 et déclaré variant d'intérêt par l'Organisation mondiale de la santé en décembre 2023. Début 2024, il était devenu le variant le plus dominant en Australie et dans une grande partie du reste du monde, entraînant de grandes vagues d'infections. .À mesure que de nouveaux variants apparaissent, les scientifiques travaillent dur pour tenter de comprendre leur impact potentiel. Cela comprend le séquençage de leurs gènes et l’évaluation de leur potentiel à transmettre, infecter et provoquer des maladies.

Fin 2023, les scientifiques ont détecté une gamme de sous-variantes de JN.1 dans les eaux usées des États-Unis. Depuis, ces sous-variantes JN.1, dont KP.1.1, KP. et KP.3, sont apparus et sont devenus plus courants dans le monde.

Mais pourquoi le nom FLiRT ? Le séquençage de ces sous-variants a révélé un certain nombre de mutations ne dans la protéine de pointe du virus, notamment F456L, V1104L et R346T. Le nom FLiRT a été inventé en combinant les lettres de ces mutations.La protéine Spike est une protéine cruciale à la surface du SRAS-CoV-2 qui donne au virus sa forme épineuse et qu’il utilise pour se fixer à nos cellules. Les acides aminés sont les éléments de base qui se combinent pour former des protéines et la protéine de pointe compte 1 273 acides aminés.

Les chiffres font référence à l’emplacement des mutations dans la protéine Spike, tandis que les lettres désignent la mutation de l’acide aminé. Ainsi, par exemple, F456L désigne le passage de F (un acide aminé appelé phénylalanine) à L (l'acide aminé leucine en position 456.

Que savons-nous des caractéristiques de FLiRT ?Les régions de la protéine Spike où les mutations ont été trouvées sont importantes pour deux raisons principales. Le premier est la liaison des anticorps, qui influence la mesure dans laquelle le système immunitaire peut reconnaître et neutraliser le virus. Le second est la liaison du virus aux cellules hôtes, qui est nécessaire pour provoquer une infection.

Ces facteurs expliquent pourquoi certains experts ont suggéré que les sous-variantes FLiRT pourraient être plus transmissibles que les variantes précédentes du COVID.Il existe également des suggestions très précoces selon lesquelles les sous-variantes FLiRT pourraient mieux échapper à l'immunité contre les infections antérieures et la vaccination que la variante parentale JN.1. Cependant, cette recherche n'a pas encore été évaluée par des pairs (vérifiée de manière indépendante par d'autres chercheurs).

Parmi les nouvelles plus positives, rien ne prouve que les variantes FLiRT provoquent une maladie plus grave que les variantes précédentes. Pourtant, cela ne signifie pas qu’attraper une infection COVI provoquée par FLiRT est sans risque.

Dans l’ensemble, cependant, les recherches publiées sur ces nouvelles sous-variantes de FLiRT n’en sont qu’à leurs débuts. Nous aurons besoin de données évaluées par des pairs pour mieux comprendre les caractéristiques de FLiRT.Bien que les sous-variantes FLiRT aient été détectées plus récemment en Australie, elles semblent gagner du terrain. Par exemple, les données de NSW Health jusqu'à la mi-mai montrent que la proportion d'échantillons KP.2 et KP.3 continue d'augmenter.

Dans d’autres parties du monde, comme au Royaume-Uni, la sous-variante FLiRT est également en augmentation.

En Australie, alors que les températures continuent de baisser et que nous nous dirigeons vers les mois d'hiver, la circulation des virus respiratoires augmente généralement et le nombre de cas atteint un sommet.On s’attend donc à ce que le nombre de cas de COVID augmente. Et comme les sous-variantes FLiRT montrent des preuves d’une « forme physique » accrue, ce qui signifie qu’elles représentent un défi plus important contre les défenses immunitaires de notre corps, il est possible qu’elles prennent bientôt le relais en tant que sous-variantes dominantes circulant en Australie.

Comment puis-je rester protégé ?Comme les variantes FLiRT descendent d’Omicron, le booster actuellement disponible en Australie, contre Omicron XBB.1.5, est susceptible d’offrir une protection substantielle. Même s’il n’est pas garanti d’empêcher l’infection, les vaccins COVI continuent d’offrir une forte protection contre les maladies graves. Alors si vous êtes éligible, pensez à vous procurer un rappel pour vous protéger cet hiver.

Le SRAS-CoV-2 est désormais un virus endémique, ce qui signifie qu’il continuera à circuler dans le monde. Pour ce faire, le virus mute – généralement légèrement – ​​pour survivre.

Les nouvelles sous-variantes FLiRT en sont d’excellents exemples, où le virus mute suffisamment pour continuer à circuler et provoquer des maladies. Jusqu’à présent, rien ne suggère que ces sous-variantes provoquent des maladies plus graves. Il est plus probable qu’ils amèneront les gens à attraper à nouveau le COVID.Bien que les informations dont nous disposons à ce stade ne nous inquiètent pas spécifiquement concernant les variantes FLiRT, nous sommes néanmoins confrontés à une nouvelle augmentation des infections au COVID. Et nous savons que les personnes plus âgées ou vulnérables, par exemple en raison de problèmes de santé qui compromettent leur système immunitaire, continuent d'être plus à risque. (La conversation) NSA

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